Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG12O94817 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG12O94817 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG12O94817 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG12O94817 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms