Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSCO60682 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSCO60682 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSCO60682 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSCO60682 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSCO60682 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSCO60682 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MSCO60682 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSCO60682 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSCO60682 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSCO60682 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSCO60682 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms