Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSPAN2O60636 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms