Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPLO60437 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPLO60437 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPLO60437 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPLO60437 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPLO60437 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PPLO60437 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPLO60437 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPLO60437 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPLO60437 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPLO60437 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPLO60437 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPLO60437 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPLO60437 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PPLO60437 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPLO60437 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPLO60437 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPLO60437 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPLO60437 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PPLO60437 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPLO60437 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPLO60437 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPLO60437 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPLO60437 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPLO60437 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPLO60437 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPLO60437 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPLO60437 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPLO60437 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPLO60437 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPLO60437 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPLO60437 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPLO60437 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPLO60437 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPLO60437 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPLO60437 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms