Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTIFO43310 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTIFO43310 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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