Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFRA2O00451 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFRA2O00451 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms