Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIP1O00291 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIP1O00291 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIP1O00291 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIP1O00291 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIP1O00291 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIP1O00291 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms