Protein–RNA interactions for Protein: J3QLI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLI3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QLI3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QLI3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QLI3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QLI3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QLI3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QLI3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QLI3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QLI3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QLI3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QLI3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms