Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
E9PCH4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
E9PCH4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
E9PCH4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
E9PCH4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
E9PCH4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
E9PCH4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
E9PCH4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
E9PCH4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
E9PCH4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
E9PCH4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E9PCH4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
E9PCH4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
E9PCH4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
E9PCH4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
E9PCH4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
E9PCH4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
E9PCH4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
E9PCH4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
E9PCH4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
E9PCH4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
E9PCH4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
E9PCH4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
E9PCH4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
E9PCH4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
E9PCH4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
E9PCH4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
E9PCH4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
E9PCH4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
E9PCH4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
E9PCH4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
E9PCH4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
E9PCH4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
E9PCH4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
E9PCH4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
E9PCH4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
E9PCH4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
E9PCH4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
E9PCH4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
E9PCH4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms