Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQI7

KLF18, Kruppel-like factor 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF18A0A0U1RQI7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF18A0A0U1RQI7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms