Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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