Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms