Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC010478.1-201ENST00000601500 6762 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 DMBT1-207ENST00000619379 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 KCNK10-203ENST00000340700 7501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 RUNX1T1-252ENST00000617740 7627 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms