Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 LINC00598-212ENST00000637124 905 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 SLC16A12-201ENST00000371790 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 MPI-213ENST00000566377 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 GIMAP2-201ENST00000223293 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 ERBB3-213ENST00000549832 3289 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 ERG-204ENST00000398907 4809 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AP000445.1-201ENST00000526692 741 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 LINC02385-201ENST00000547554 428 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AL157359.3-201ENST00000623771 217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 GABPB1-205ENST00000429662 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 ZNF665-201ENST00000396424 4159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 MS4A6A-203ENST00000426738 1736 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 SRSF10-207ENST00000453840 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 AC117529.1-201ENST00000505789 2023 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CABP2Q9NPB3 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194 ms