Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IMPG1Q17R60 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms