Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

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Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBE3AQ05086 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBE3AQ05086 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBE3AQ05086 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBE3AQ05086 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBE3AQ05086 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBE3AQ05086 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBE3AQ05086 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBE3AQ05086 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
UBE3AQ05086 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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