Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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COL4A5P29400 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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COL4A5P29400 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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COL4A5P29400 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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COL4A5P29400 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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COL4A5P29400 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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COL4A5P29400 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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COL4A5P29400 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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COL4A5P29400 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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COL4A5P29400 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
COL4A5P29400 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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