Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL353898.3-201ENST00000624679 1755 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P10-201ENST00000475365 1390 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CORIN-205ENST00000504584 2417 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ANXA2P3-201ENST00000404883 1008 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL008626.1-201ENST00000412357 775 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RBM22P7-201ENST00000421321 280 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2P24-201ENST00000433516 273 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC00265-202ENST00000448955 468 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC093157.1-205ENST00000449473 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC02016-201ENST00000488425 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL792P-201ENST00000496286 305 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SNORA70.23-201ENST00000517218 151 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR4C9P-201ENST00000532368 925 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC012038.1-201ENST00000551279 552 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CASC15-205ENST00000606336 1288 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL117372.1-201ENST00000613711 459 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC02391-201ENST00000615716 800 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL356289.1-201ENST00000635446 743 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SAG-201ENST00000409110 1591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms