Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 TRIM60P19-201ENST00000452879 1462 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC091563.1-201ENST00000520544 490 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 SLC8A1-206ENST00000406391 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SPTBN1Q01082 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms