Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC097717.1-227ENST00000594069 1322 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 FAM177B-204ENST00000445590 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PDE4DIP-241ENST00000616206 874 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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