Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms