Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 HRNR-201ENST00000368801 9623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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PTPRMP28827 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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PTPRMP28827 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PTPRMP28827 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PTPRMP28827 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PTPRMP28827 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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PTPRMP28827 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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PTPRMP28827 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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