Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms