Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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