Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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