Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PDK4Q16654 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PDK4Q16654 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PDK4Q16654 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 FAM177B-204ENST00000445590 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PDK4Q16654 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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