Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms