Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms