Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U3KQK5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQK5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQK5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQK5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQK5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQK5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQK5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQK5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms