Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U3KQE9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U3KQE9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U3KQE9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
U3KQE9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms