Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms