Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms