Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms