Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLF12Q9Y4X4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms