Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms