Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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SH3BP1Q9Y3L3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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