Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms