Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms