Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms