Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms