Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms