Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNZ2

NSFL1C, NSFL1 cofactor p47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFL1CQ9UNZ2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSFL1CQ9UNZ2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSFL1CQ9UNZ2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms