Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
L1RE1Q9UN81 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms