Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms