Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms