Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms