Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DBF4Q9UBU7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms