Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAE1Q9UBE0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms