Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH10Q9P2E7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms