Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA3Q9NZ52 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms